根据《标准勘察招标文件》中的相关规定，发包人应在收到预付款支付申请后的28天内，将预付款支付给勘察人。具体条款如下：定金或预付款：定金或预付款应专用于本工程的勘察。发包人应在收到定金或预付款支付申请后28天内，将定金或预付款支付给勘察人；勘察人应当提供等额的增值税发票。根据题目中的信息，勘察人于2025年4月1日向发包人提交了预付款支付申请。因此，发包人应在此后的28天内支付预付款。计算28天的时间：从2025年4月1日开始计算28天。2025年4月1日+28天=2025年4月29日。因此，发包人应向勘察人支付预付款的最迟时间是2025年4月29日综上所述，正确答案是D.2025年4月29日。