水利工程建设阶段中，应编制投资估算的阶段包括：
项目建议书阶段(B)。
可行性研究报告阶段(D)。
初步设计阶段(A)编制的是工程概算，项目规划阶段(C)和施工图设计阶段(E)不直接涉及投资估算的编制。