根据《水运工程混凝土试验检测技术规范》(JTS/T 236—2019)关于碎石和卵石的缩分规定，“缩分时应将样品置于平板上，在自然状态下拌均匀，并堆成锥体，然后沿互相垂直的两条直径把锥体分成大致相等的四份，取其对角的两份重新拌匀，再堆成锥体”。因此应取对角的两份，选项B正确，选项A、C、D错误。