建设工程质量管理体系既不是业主方也不是施工方的质量管理体系或质量保证体系，而是整个建设工程项目目标控制的一个工作系统，其性质如下：
（1）工程质量管理体系是以工程项目为对象，由工程项目实施的总组织者负责建立的面向项目对象开展质量控制的工作体系。
（2）工程质量管理体系是工程项目管理组织的一个目标控制体系，它与项目投资控制、进度控制、职业健康安全与环境管理等目标控制体系，共同依托于同一项目管理组织机构。
（3）工程质量管理体系根据工程项目管理的实际需要而建立，随着工程项目的完成和项目管理组织的解体而消失，因此，是一个一次性的质量管理工作体系，不同于企业质量管理体系。