地基与基础工程主要包括：地基、基础、基坑支护、地下水控制、土方、边坡、地下防水等子分部工程。
C选项错误，灰土地基属于地基的分项工程；
D选项错误，土方开挖属于土方的分项工程；
E选项错误，降水与排水属于地下水控制的分项工程。