本题考查的是担保方式。同一财产向两个以上债权人抵押的，拍卖、变卖抵押财产所得的价款依照下列规定清偿:
（1）抵押权已登记的，按照登记的先后顺序清偿;顺序相同的，按照债权比例清偿;
（2）抵押权已登记的先于未登记的受偿;
（3）抵押权未登记的，按照债权比例清偿。
抵押物已登记的先于未登记的受偿。因B银行的2000万元已登记，故偿还B银行2000万元，剩余1000万元用于偿还A银行。